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Uno dei problemi principali connessi alla tecnica irrigua a goccia è rappresentato dalla possibile occlusione degli apparecchi erogatori causata da materiale trasportato in sospensione dalla corrente idrica.
Qualitativamente è possibile descrivere le cause e distinguere le tipologie dell'occlusione in: occlusione di tipo fisico dovuta ai solidi sospesi inorganici (limo, sabbia e argilla) e ai solidi sospesi organici (alghe, resti di piante e animali acquatici, etc.), che possono accumularsi fino a bloccare l'erogatore;
occlusione di tipo chimico dovuta alla precipitazione dei carbonati di calcio e magnesio e degli ossidi di ferro e di manganese. La precipitazione può essere favorita dall'aumento del pH e della temperatura o dalla presenza in soluzione di altri ioni, come per esempio quelli apportati dai fertilizzanti; occlusione di tipo biologico dovuto all'attività microbica che può produrre fanghiglia organica, filamenti e depositi.